生物制造有機肥料國家補貼主要包括以下幾個方面：

一、稅收優惠政策

增值稅免征：對納稅人生產銷售和批發、零售有機肥料(包括生物有機肥)免征增值稅。

增值稅退稅：對農作物秸稈、林業三剩物綜合利用產品，實行一定比例的增值稅退稅政策。

企業所得稅優惠：享受減半征收企業所得稅優惠政策的小微企業年應納稅所得額上限已經從50萬元提高至100萬元。

稅前扣除：對企業新購入500萬元以下設備、器具的支出，允許在當年一次性稅前扣除。

二、專項補貼政策

國家會對符合特定條件的有機肥生產廠家提供專項補貼，這些條件通常包括：

生產原料：使用畜禽糞便、農作物秸稈等為主要生產原料。

產品質量：生產的商品有機肥符合國家或部頒標準。

生產規模：年生產規模達到一定量，如年產10000噸以上。

企業資質：具有獨立的法人資格，合法經營的肥料生產企業，并具有正規的肥料產品登記證，產品經質檢部門抽查合格。

肥效顯著：每年經市農業部門組織的肥料產品正規小區試驗，肥效顯著。

本地使用量大：在本地使用量較大的肥料生產企業。

符合上述條件的有機肥生產廠家可以向所在區農業主管部門及財政部門申報補貼，經過審核確認后，在銷售有機肥時需建立臺帳，記錄相關信息。市農業局將會同市財政部門，對企業生產情況進行實地考察，根據企業的生產經營情況進行考核驗收，合格企業撥付補貼資金。

三、項目支持

國家還可能通過其他項目對有機肥生產廠家進行支持，例如一些地方會安排綠肥及商品有機肥示范推廣項目資金，用于支持綠肥種植和商品有機肥的示范推廣。這些項目資金不僅有助于提升有機肥的生產和銷售，還能促進有機肥技術的研發和推廣。

四、其他補貼

畜禽糞污資源化利用補貼：支持第三方處理主體糞污收集、貯存、處理、利用設施建設，以及規模養殖場改進節水養殖工藝和設備，建設糞污資源化利用配套設施等。

秸稈相關補貼：包括秸稈農機補貼、秸稈三貯一化利用補助、秸稈綜合利用能源化補助以及秸稈粉碎還田補助等，這些補貼政策間接促進了有機肥的生產。

總的來說，生物制造有機肥料的國家補貼政策涵蓋了稅收、專項補貼、項目支持以及其他相關補貼等多個方面，旨在促進有機肥產業的發展，減少化肥的過量使用，改善土壤質量，并保護生態環境。